最近使った基底関数の話題。 有機化学界隈だと、基底関数というと一般的にsplit valence基底系、特にpopleの6-31Gなどがメジャーで、信頼できる魔法の呪文「B3LYP/6-31G」の一部みたいに考えられているような節があるが、Correlation-consistent基底系（cc-p…
おれは、やめるぞ、酒を。 ＜追記＞ １ヶ月の禁酒に成功した
だいぶ遅れてしまったが、今年の目標として、自分で分子動力学プログラムを書いて走らせてみることと、Pythonを使って現在使ってるプログラムを見やすく書き直してみる事を挙げてみたいと思う。 これまでの人生でプログラミングから逃げてきたので、そろそろ…
本気を出すのが遅いのが自分の欠点であるが、それはともかく今回の理論選択のための予備計算で思わぬ事態が起きた。 6-31+G(d)やcc-pvdz程度ではCCSD(T)をうまく再現していなかったM06HFが、aug-cc-pvtz基底関数系を使うと最高のフィット率を叩き出したので…
とある小分子の計算を行っている。 B3LYP、M11は小さい基底関数を使ってもそこそこいいエネルギー値を出すが、二重結合との共役を含む場合のポテンシャルエネルギー曲面をうまく再現しないようだ。その点ではM06-2Xは大きな基底関数を使わない限り定量性はな…
去年は研究の主力であるNMRのデカップラーの調子が悪くて精度が出なかったり（測定のたびにデカップラーのパワーを調整している）、はたまた１ヶ月使って大量に作った化合物の反応の中間体を精査したところ、目的とする経路を経ていないから解析するに値しな…
爆発性の試薬を１０g注文したら１０００g届いた。 アメリカンサイズだ。
プログラムを走らせる時に使用プロセッサの数を間違えていたようだ。 実際に使ってるのは８つなのに１６も指定してたとの事。 いつも忘れてしまうので一括変換のコマンドをメモ。 Linuxコマンド集 - 【 find 】 ファイルやディレクトリを検索する：ITpro 【L…
研究のモチベーションが下がった。 最近朝晩寒くなり体調が悪化したためか、それとも生まれつき持ち合わせた不注意が表に出てきたからなのか、はたまたいろんな意味での人間関係の問題なのか、それとも大雨で天井から水が滴ってきたうえに亀裂が走り始めたか…
特に大きな出来事ではないが、本日自転車で移動中に自動車にぶつかった。 脇道から大通りに出ようとして停止してた自動車が、その前を通り抜けようとした自分に気づかずアクセルを踏んだ。巨大な力になすすべもなく押された。 幸いけがはなく、自転車にも損…
落ち込んでいる。英語がしゃべれなくなった。 アメリカに来て英語にまみれたら、英語がしゃべれなくなっていた。 逆説的だね。ひどいもんだね。 博士課程在学中に学んだ研究室では結構な数の留学生がいたため、英会話には慣れているつもりだった。確かに日本…
現在の大学ではVarianのVNMRを使っているのだが、測定後のプロセッシングのUIがあまりにも使いにく過ぎる。画像ファイルやpdfなどで保存もできないしひどい。 そのため富士通が無償で提供している以下のソフトをダウンロードして使い始めた。 www.fujitsu.co…
新生活を行う上でスマートフォンの利用は欠かせない。とくに、右も左もわからない国外の地で生活をスタートするにあたっては、最初からインターネットに接続できることが望ましい。そこで頼りになるのが日本で契約できるアメリカの回線を利用したサービスで…
これまでに何度か違うラボに移っているので、そのたびにカルチャーショックというのを体験する。新しい環境への違和感や当惑といった原始的な感情は、時間が経つにつれて次第に感嘆/敬意/反感等の混じった複雑な感情に落ち着いて行く。同じ状況でも抱く感情…
研究留学で最も重要なことは次のキャリアにつながる研究成果を出し、語学能力を高め、そしてネットワーキングをすることだと思うが、それらの活動を行う上で重要になるのが居住地の確保である。これができない限りホテル代が嵩み、研究どころか生活が危うく…
